MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Rickettsia prowazekii str. BuV67-CWPP chromosome

Total Repeats: 8080

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017056	ATT	2	6	834	839	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017056	TATT	2	8	869	876	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017056	GTT	2	6	884	889	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017056	ACA	2	6	927	932	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_017056	ACA	2	6	963	968	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_017056	ATTT	2	8	1300	1307	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017056	TAG	2	6	5885	5890	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017056	ATT	2	6	5896	5901	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017056	TCT	2	6	5902	5907	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_017056	GTT	2	6	5909	5914	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017056	TAA	2	6	5927	5932	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017056	TA	3	6	5937	5942	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017056	T	8	8	5994	6001	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017056	CAT	2	6	6022	6027	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_017056	TAA	2	6	6037	6042	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017056	ATA	2	6	6120	6125	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017056	GGCT	2	8	6126	6133	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
18	NC_017056	TA	4	8	6156	6163	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017056	ATT	2	6	6174	6179	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017056	TTTA	2	8	6199	6206	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017056	TAAA	2	8	6218	6225	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017056	TTA	2	6	7503	7508	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017056	ATT	2	6	7554	7559	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017056	AT	3	6	7580	7585	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017056	ACA	2	6	7637	7642	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_017056	TA	3	6	8733	8738	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017056	TAT	2	6	8750	8755	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017056	TGACT	2	10	8807	8816	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
29	NC_017056	TTA	2	6	8863	8868	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017056	TAA	2	6	8904	8909	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017056	ATTT	2	8	8915	8922	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017056	TTTA	2	8	8963	8970	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017056	GATAC	2	10	8991	9000	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
34	NC_017056	TTA	2	6	9008	9013	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017056	A	6	6	9067	9072	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017056	ACC	2	6	9081	9086	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
37	NC_017056	GTA	2	6	9112	9117	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017056	CAT	2	6	9142	9147	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_017056	ATT	2	6	9155	9160	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017056	CAT	2	6	9178	9183	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_017056	ACA	2	6	9190	9195	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_017056	TAA	2	6	9199	9204	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017056	TATT	2	8	9211	9218	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017056	TAAT	2	8	9257	9264	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017056	TTA	2	6	9340	9345	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017056	ATTTA	2	10	9350	9359	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017056	TAT	2	6	9402	9407	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017056	AAT	2	6	9452	9457	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017056	TAT	2	6	9476	9481	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017056	AGA	2	6	11824	11829	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017056	ATA	2	6	14381	14386	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017056	TTA	2	6	14391	14396	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017056	TA	3	6	14403	14408	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017056	GTT	2	6	14446	14451	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017056	TTA	2	6	14460	14465	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017056	GTA	2	6	14477	14482	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017056	A	7	7	14482	14488	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017056	TTG	2	6	14513	14518	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017056	ATT	2	6	14527	14532	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017056	T	6	6	14564	14569	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017056	AT	3	6	14571	14576	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017056	TA	3	6	14599	14604	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017056	TAAAC	2	10	14654	14663	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
64	NC_017056	ATT	2	6	14678	14683	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017056	ATC	2	6	14718	14723	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_017056	TAAG	2	8	14774	14781	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017056	ATTA	2	8	14795	14802	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017056	AAG	2	6	14829	14834	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017056	AAAG	2	8	14864	14871	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017056	A	6	6	14911	14916	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017056	ATT	2	6	14939	14944	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017056	TTG	2	6	14952	14957	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017056	ATT	2	6	14998	15003	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017056	AT	3	6	15015	15020	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017056	TTAT	2	8	15035	15042	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017056	TAA	2	6	17871	17876	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017056	A	7	7	17882	17888	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017056	GAA	3	9	17911	17919	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017056	ATA	2	6	19090	19095	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017056	ACC	2	6	19140	19145	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
81	NC_017056	ATA	2	6	19237	19242	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017056	TAA	2	6	19250	19255	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017056	AAG	2	6	19272	19277	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017056	TTA	2	6	19314	19319	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017056	ATTTA	2	10	19324	19333	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017056	CTT	2	6	19388	19393	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_017056	TATT	2	8	19394	19401	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017056	ATCTAA	2	12	19403	19414	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
89	NC_017056	ATT	2	6	19415	19420	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017056	TAG	2	6	19451	19456	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017056	AGTTT	2	10	19522	19531	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017056	A	6	6	19554	19559	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017056	GTAA	2	8	19568	19575	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017056	AAT	2	6	19580	19585	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017056	TTAT	2	8	19646	19653	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017056	TCAA	2	8	19678	19685	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
97	NC_017056	AT	3	6	19687	19692	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017056	CAT	2	6	19738	19743	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_017056	TATAA	2	10	19755	19764	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017056	GTAA	2	8	19847	19854	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017056	TA	3	6	19874	19879	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017056	AT	3	6	19887	19892	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017056	TAG	2	6	19907	19912	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017056	GTA	2	6	20031	20036	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017056	TAA	2	6	20037	20042	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017056	ATAG	2	8	20082	20089	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017056	AAT	2	6	20114	20119	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017056	A	8	8	20127	20134	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017056	A	8	8	20150	20157	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017056	ATTA	2	8	20186	20193	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017056	GAA	2	6	20214	20219	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017056	TAA	2	6	20232	20237	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017056	A	11	11	20243	20253	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017056	TAG	2	6	20254	20259	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017056	AGT	2	6	20347	20352	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017056	TAT	2	6	20408	20413	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017056	A	6	6	20424	20429	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017056	AAT	2	6	20435	20440	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017056	TA	3	6	20445	20450	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017056	AT	3	6	20541	20546	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017056	AATCT	2	10	20567	20576	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
122	NC_017056	ATT	2	6	20594	20599	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017056	AAG	2	6	20653	20658	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017056	GTT	2	6	20683	20688	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017056	AAT	2	6	20720	20725	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017056	ATCA	2	8	20750	20757	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
127	NC_017056	ATA	2	6	20780	20785	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017056	A	6	6	21090	21095	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017056	TGA	2	6	21102	21107	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017056	AACA	2	8	21111	21118	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
131	NC_017056	GTAT	2	8	21150	21157	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017056	TAAT	2	8	22423	22430	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017056	AT	3	6	24357	24362	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017056	TAG	2	6	24401	24406	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017056	CAC	2	6	24437	24442	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
136	NC_017056	GGA	2	6	24443	24448	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017056	TAC	2	6	24993	24998	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_017056	TCTT	2	8	25038	25045	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
139	NC_017056	TTA	2	6	25168	25173	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_017056	TAAA	2	8	26858	26865	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_017056	A	7	7	26863	26869	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_017056	TA	3	6	26907	26912	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_017056	TTA	2	6	26916	26921	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_017056	TTC	2	6	26936	26941	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
145	NC_017056	ATT	2	6	26949	26954	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_017056	ATT	2	6	27031	27036	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_017056	CAG	2	6	27060	27065	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
148	NC_017056	AAT	2	6	28191	28196	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_017056	ATT	2	6	28203	28208	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_017056	AT	3	6	28210	28215	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_017056	TAG	2	6	28243	28248	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
152	NC_017056	AT	4	8	28273	28280	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_017056	ATT	2	6	28299	28304	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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158	NC_017056	TGA	2	6	28635	28640	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
159	NC_017056	T	6	6	28647	28652	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
160	NC_017056	TAA	2	6	28702	28707	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
161	NC_017056	A	8	8	28749	28756	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
162	NC_017056	CAT	2	6	28765	28770	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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164	NC_017056	TAA	2	6	28784	28789	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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166	NC_017056	TCA	2	6	28946	28951	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
167	NC_017056	TAT	2	6	28970	28975	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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172	NC_017056	AT	3	6	29075	29080	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
173	NC_017056	ATAA	2	8	29089	29096	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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184	NC_017056	ATT	2	6	29330	29335	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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291	NC_017056	GTA	2	6	36551	36556	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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